INN139994

A projekt tartalmának bemutatása:

"A projekt egyik célja a burgonya legveszélyesebb kórokozóival, mint a PVY vírus, illetve a fitoftóra (Phytophthora infestans) szemben rezisztenciát biztosító gének azonosítása molekuláris genetikai eszközökkel. A projekt másik célja a szárazságtűrés genetikai hátterének feltárása a burgonyában. Első lépésben a vizsgálatokban rferenciagenomként használandó White Lady fajta teljes genomi szekvenciáját készítettük el rövid (150 bp) és hosszú (átlagosan 8 000 bp) leolvasásokból.
Mindkét cél esetében transzkriptomikai és microarray alapú megközelítést alkalmazunk. A PVY extrém rezisztenciát biztosító Solanum andigena eredetű, ez idáig még nem izolált, de a nemesítésben felhasznált Ryadg gén genomi lokalizálásához ötféle genotípus hat fertőzés utáni mintájából készített transzkriptom expressziós változásait hasonlítjuk a fertőzés előtti transzkriptomhoz. Három hasadó populációban pedig összesen 280 F1 genotípuson a több, mint 33 000 SNP-t tartalmazó burgonya DNS-chip segítségével generált nagy telítettségű térképen lokalizáljuk a jelentős expressziós változást mutató transzkripteket, valamint az rezisztenciagénekre jellemző motívumokat tartalmazó szekvenciákat.
A fitoftóra rezisztencia vizsgálatokhoz szintén a fenti stratégiát alkalmaztuk, annyi változtatással, négy fajta, négy fertőzés utáni időpontban készített transzkriptomot vizsgálunk. A vizsgált rezisztenciagének pedig egy S. hougasii eredetű gén, valamint nyolc rasszspecifikus S. demissum eredetű fitoftóra rezisztenciagén.
A szárazságtűrés  vizsgálatokban a Démon és a Hópehely keszthelyi nemesítésű, a vízmegvonásra eltérően reagáló burgonya fajta összesen tíz transzkriptomjában keressük a szárazságtűréssel összefüggésbe hozható géneket.
Kutatási eredményeinket legalább három darab Q1 besorolású szaklapban megjelentetett publikációban tervezzük közölni."