K143409

A projekt tartalmának bemutatása:

Az epigenetikai módosításoknak (pl. hiszton kód, DNS-metiláció) fontos szerepe van a növényfejlődés szabályozásában azáltal, hogy meghatározzák és fenntartják a sejttípus-specifikus génexpressziós mintázatot. A hiszton módosítások közül az acetilálás/deacetilálás fontos szereppel bír a transzkripció szabályozásában. A pályázat során azt szeretnénk vizsgálni, hogy az epigenetikai változásoknak milyen szerepe van a paradicsom levélszőr fejlődésére. Korábban SlIDM1 hiszton-acetiltranszferáz mutáns paradicsomvonalakat állítottunk elő és megfigyeltük, hogy ezek a növények több fedőszőrrel és mirigyszőrrel rendelkeznek mind a szárukon, mind a levelükön, mint vad típusú társaik. Az SlIDM1 gén az Arabidopsis AtIDM1 gén paradicsom ortológja. Az AtIDM1 a „mester regulátora” az Arabidopsis AtROS1 által közvetített genom szintű
DNS citozin demetilációnak. Mivel a paradicsom SlIDM1 az Arabidopsis AtIDM1 ortológja, és a hiszton acetiláció általában a génaktivációhoz kapcsolódik, előzetes eredményeink alapján feltételezzük, hogy az SlIDM1 szabályozza a levélszőr
fejlődésért felelős gének expresszióját azáltal, hogy megakadályozza azok hipermetilációját. A kutatási pályázat során az SlIDM1 által szabályozott, levélszőr fejlődésért felelős géneket szeretnénk genomszinten azonosítani. Tervezzük továbbá az
SlIDM1 fehérje időbeli és térbeli expressziós mintázatának vizsgálatát a növény fejlődése során. Arabidopsisban az AtROS1 DNS-demetiláz „target szelekcióját” az IDM fehérje komplex határozza meg. A paradicsom IDM komplexében résztvevő és a levélszőr fejlődését szabályozó fehérjefaktorok kísérleti azonosításához immunoprecipitációs kísérleteket tervezünk végezni.